R語言學習 - 熱圖繪製 (heatmap)

熱圖繪製 熱圖是做分析時常用的展示方式,簡單、直觀、清晰。可以用來顯示基因在不同樣品中表達的高低、表觀修飾水平的高低等。任何一個數值矩陣都可以通過合適的方式用熱圖展示。 本篇使用R的ggplot2包實現從原始數據讀入到熱圖輸出的過程,並在教程結⋯ 閲讀全文

如何獲取目標基因的轉錄因子(上)

——Biomart下載基因和motif位置信息 科研過程中我們經常會使用Ensembl(http://asia.ensembl.org/index.html) 網站來獲取物種的參考基因組,其中BioMart工具可以獲取物種的基因注釋信息,以及跨資料庫的⋯ 閲讀全文

增強火山圖,要不要試一下?

包作者:Kevin Blighe撰文:協和醫學院 苑曉梅編輯:生信寶典 時間:2019-06-03 前言 最近道聽途說EnhancedVolcano繪製火山圖的方便性,所以本人就根據其說明文檔進行操作。但在操作過程中發現,其shape功能並沒有⋯ 閲讀全文